В.В.Вьюгин, В.А.Любецкий

Об одном алгоритме поиска горизонтального переноса генов на основе филогенетических деревьев белков

Целью работы является разработка методов для получение информации о событиях, происходивших в процессе эволюции в геномах организмов на молекулярном уровне, на основе филогенетических данных. В данной работе мы предлагаем некоторый метод для выявления генов, которые возможно попали в геном организма в результате горизонтального переноса, на основе вызываемой ими рассогласованности между деревьями эволюции генов и видов. Горизонтальный перенос генов определяется как перемещение генов между организмами без участия механизмов репродукции. Данный метод применяется к данным о 26 группах микроорганизмах и 132 КОГах – комплексов ортологических групп генов, объединенных по функциональному признаку из базы данных GenBank Национального центра биотехнологической информации США.