В.В.Вьюгин, В.А.Любецкий
О некоторых способах отбора горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных
В работе предлагается некоторые способы отбора генов, которые возможно попали в геном организма в результате горизонтального переноса генов. Отбор таких генов производится на основе вызываемой ими рассогласованности между деревьями эволюции генов и видов. Горизонтальный перенос генов определяется как перемещение генов между организмами без участия механизмов репродукции. Предлагаемая методика применяется к данным о 40 микроорганизмах и 132 КОГах — комплексов ортологических групп генов, объединенных по функциональному признаку из базы данных GenBank Национального центра биотехнологической информации США.